Es ermöglicht die absolute Quantifizierung von DNA- und RNA-Targets mithilfe der digitalen PCR-Technologie. Das Digital LightCycler System bietet Laboren Flexibilität durch drei Reaktionsplatten mit einer jeweils unterschiedlichen Anzahl an Nanowells. Das System zeichnet sich außerdem durch einen einfachen und effizienten Arbeitsablauf aus, der robuste Ergebnisse liefert.

Das Digital LightCycler System ermöglicht es, DNA und RNA aus einer bereits extrahierten Probe in bis zu 100.000 mikroskopisch kleine Reaktionskammern aufzuteilen. Anhand dieser Partitionen werden die Zielsequenzen in isolierten Mikroreaktoren effizient konzentriert. Diese Konzentration reduziert die Template-Konkurrenz und ermöglicht den Nachweis seltener Mutationen sowie eine höhere Toleranz gegenüber in einer Probe vorhandenen Inhibitoren. Die Ergebnisse der digitalen PCR können im Nachgang mittels der entsprechenden Software analysiert und ausgewertet werden.

In Bereichen wie Onkologie und Infektionskrankheiten bietet das System den Forschern neue Möglichkeiten, die über die herkömmliche PCR-Technologie hinausgehen. Dazu gehören der Nachweis spezifischer Nukleinsäuresequenzen einer sehr geringen Allelfrequenz, die genaue Quantifizierung der Menge der Ziel-DNA oder -RNA auf molekularer Ebene und andere hochpräzise Analysen.